一位名为才贺胜的小学5年级学生，在父亲因事故去世后继承了庞大的遗产，生命也因此受到了威胁。就在此时，一位名为加藤鸣海的青年偶然与胜相遇，并决定向他伸出援手。 然而，追杀胜的并非人类，而是具备高超战斗能力的傀儡使们。就在两人陷入绝境的时候，一位操纵着悬丝傀儡的银发少女·白银突然出现，拯救了他们。 就这样，在日本相识的这三人开始被卷入多舛的命运齿轮当中——
拓展出无限可能性的虚拟现实大型多人在线角色扮演游戏《方舟地球网络版》。玩家建立的国度阿尔凯特王国拥有九位贤者，其中有一位威风凛凛的老年召唤术士名叫邓不利夫，是游戏玩家之一。某一天，他感受到世界发生了异常的变化。不仅产生了游戏中本没有的味觉和嗅觉，更是无法退出游戏。甚至在非玩家角色身上发现了酷似人类的反应。这证明了游戏已经成为了不折不扣的现实。而且这个世界已经走过了足足30年。更不可思议的是，邓不利夫因为种种原因身体变成了幼小而美丽的少女！为了解开面目全非的世界之谜，邓不利夫自称为贤者的弟子米菈踏上了旅途。在冒险的最后等待他的会是什么呢——。
