支配著地球上所有法則的是被成為『共存均衡』的巨大力量；『元靈神』是擁有超越人類能力並為了守護這個均衡的存在；擁有相同的外表和共同的命運的三個靈魂的『三位一體』；等待在神秘的另一端的、經歷殘酷而壯烈的戰鬥……
走りで最強を目指すと豪語するジャングルポケットは＜トゥインクル・シリーズ＞でのフジキセキの走りに衝撃を受け、レースの世界に飛び込む。 トレーナーと共にデビューを果たしやジャングルポケットは、一生に一度しか走れない栄誉あるクラシック三冠レースに挑む。 しかしそこに立ちふさがったのはアグネスタキオンやマンハッタンカフェといった同世代のライバルたちだった。 新時代の扉を開く熱き戦いが、いま始まる―。
