作为网络吉他手“吉他英雄”而广受好评的后藤一里，在现实中却是个什么都不会的沟通障碍者。一里有着组建乐队的梦想，但因为不敢向人主动搭话而一直没有成功，直到一天在公园中被伊地知虹夏发现并邀请进入缺少吉他手的“结束乐队”。可是，完全没有和他人合作经历的一里，在人前完全发挥不出原本的实力。为了努力克服沟通障碍，一里与“结束乐队”的成员们一同开始努力……
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
在艾倫他們居住的帕拉迪島之外，還存在一個其他人類居住的世界。當中一個國家「瑪雷」與其他各國爆發戰爭。陷入苦戰之際，他們決定要攻進帕拉迪島，把「始祖的巨人」搶過來。在這裏又看到另一羣孩子們拼命求生存的身影……。
