背景是大多数城市，某个国家/地区的城市。在一栋老楼的二楼，有一家小出版社，出版《月刊妄想科学》。《月刊妄想科学》是一个离奇的“莫~惊讶”的案例，甚至连科学家都“莫~不可能！ 它是一本科学期刊，撰写有关过度科学现象的文章。唯一的工作人员是美丽的主编和编辑铃木太郎。除此之外，只有小学生田中次郎和他的狗三郎的助手。编辑部总是空无一人，太郎、次郎和三郎沉浸在同一栋楼一楼的咖啡馆“Rock”里。有一天，一位名叫佐藤五郎的科学家来访寻求建议，一个离奇的故事开始了......
4年了，距离那场私人武装组织——天人与人类联盟军的决战过去4年了。 天人组织消失了，世界从3个巨大的国家联盟统一为一个联合政府，世界已经统一。但是，这只是表象。表面的政治统一，但军方秘密组织A-LAWS在暗中从事武装镇压，镇压所有反对联合政府的组织与团体。这样的世界，没有改变。人类依然没有从战争、纷争、矛盾之中解脱出来。天人组织再次回归！高达驾驶员刹那•F•清英驾驶新型号的机器人——高达00再次武力介入。这次，天人组织要面对的不仅是A-LAWS的机动战士部队，还有神秘组织变革者——其首领里冯兹正在计划一个更大的阴谋！ 《机动战士高达00》系列动画片第2季。
